El principal objetivo de la Reserva Natural es la conservación del ecosistema en su conjunto. En muchos casos es el sostén de actividades económicas de la región. Su categoría de manejo, de "Uso múltiple", establece que la reserva natural estará orientada a la experimentación del uso racional del medio y los recursos naturales. Por lo tanto, son permitidas bajo monitoreo las actividades de pesca sustentable, los deportes náuticos y el ecoturismo. Estas actividades deben realizarse de forma que no afecten la conservación integral del ecosistema.